在处理此类问题时，企业应首先明确居家办公的相关规定与员工的劳动纪律要求。若员工在居家办公期间未能达到工作要求，企业需判断其是否属于无正当理由的失职行为。同时，企业应当确保惩戒措施符合劳动法的规定，不得侵犯员工的合法权益。在本案中，若公司能够证明小李的行为属于违反劳动纪律的行为，且其惩戒措施合法合理，那么公司的做法可能是站得住脚的。

然而，企业也应注意，居家办公的特殊性决定了其管理方式应更加灵活。在保障工作效率的同时，也应尊重员工的个人空间和时间。因此，对于员工的轻微违规行为，企业应先进行沟通和提醒，而非直接采取惩戒措施。